复旦大学附属肿瘤医院病理科（以下简称科室）创立于1949年，是新中国最早的病理科之一，目前是国家重点学科、卫生部临床重点学科、国家临床重点专科、上海市医学重点学科，也是上海市临床病理质量控制中心挂靠单位。2011-2020年连续10年位列《中国医院最佳专科声誉排行榜》全国病理学科第一名，2012-2020年连续9年获得上海市优秀医疗质量质控中心称号。2013年科室成为全国首个CNAS医学实验室认可的病理科。

       科室拥有合理的空间布局，规范的工作流程，现代化的工作设备，徐汇院区4000平方米，浦东院区500平方米。在顾绥岳、张仁元、张廷璆、施达仁、杜祥、王坚先后六任主任的带领下，在王懿玲、涂莲英、许良中、刘尚廉、沈铭昌、许越香、朱雄增、施达仁教授以及科室全体人员的共同努力下，病理科取得了长足发展。截止2020年12月，病理科总计在岗215人，其中在编员工128人（包括医生50人，技术员73人，研究人员3人，生物信息分析员2人），退休返聘人员7人，规培医生48人、在岗进修医师22人、在读硕士及博士研究生27人（包含规培医生17人，科研型10人）。 作为国内开展亚专科最早、最完善的病理科室，目前已建立了包括乳腺肿瘤、消化肿瘤、胸部肿瘤、泌尿男性生殖道肿瘤、淋巴造血肿瘤、软组织和骨肿瘤、皮肤肿瘤、妇科肿瘤、头颈肿瘤、中枢神经肿瘤、细胞病理及分子病理等共12个亚专科，以及免疫病理一个辅助亚专科。其中乳腺肿瘤、软组织和骨肿瘤、淋巴造血肿瘤等亚专科在全国具有很高的知名度，多位专科负责人在全国专科病理学组担任组长或副组长，执笔多个肿瘤标记物的检测指南、诊断共识等业内标准。科室的4位专家也成为世界卫生组织乳腺肿瘤、妇科肿瘤、软组织肿瘤、淋巴造血肿瘤和头颈部肿瘤分类的编委，参与制定国际肿瘤病理诊断标准。

       病理科是全国肿瘤病理最大的会诊中心，年会诊病例从2万例增长至4万例。70%的对外会诊病例来自于长三角地区，起到长三角“龙头”作用，解决了大量疑难病例的病理诊断。除外院会诊外，每日诊断本院手术病例约200余例。分子病理发展迅速，开展项目100多项，平均年增长幅度30%以上。

       近五年来，承担国家级及省部级等各类科研项目43项，科研经费合计5500余万元（含医院配套经费）；发表SCI文章155篇。

       2008-2014年先后派出多名医生完成对新疆医科大学第一附属医院的两轮对口援助。2016年至今先后派遣多名医生对云南及西藏相关医院病理科开展对口支援。科室也是全国最大的病理进修基地，为全国培养大量的高级进修医师，被称为病理科的“黄埔军校”。目前已举办培训班78期，培训人员总计达800余人。科室每年举办全国范围内的继续教育学习班、读片会等，近5年共举办各类培训近30次，参与医师总数4000余人次。

       科室先后获得“上海市质量金奖”、“上海市三八红旗集体”、“上海市模范集体”、“上海市巾帼文明岗”等荣誉称号。